區(qū)別在于報(bào)銷(xiāo)比例不同，報(bào)銷(xiāo)的條件不同：
1、城鎮(zhèn)職工醫(yī)療保險(xiǎn)的報(bào)銷(xiāo)比例是80%，根據(jù)就診醫(yī)院的不同起付線也是不同的，三級(jí)甲等醫(yī)院的起付線要高一些；新農(nóng)合的報(bào)銷(xiāo)比例要低一些，也就是65%左右。都有用藥的限制，對(duì)于進(jìn)口藥特效藥是不報(bào)銷(xiāo)的。
2、城鎮(zhèn)職工醫(yī)療保險(xiǎn)有醫(yī)?？?，卡里的金額是個(gè)人賬戶(hù)的金額，可以用醫(yī)保卡刷卡買(mǎi)藥；而新農(nóng)合沒(méi)有個(gè)人賬戶(hù)。
3、城鎮(zhèn)職工醫(yī)療保險(xiǎn)有定點(diǎn)醫(yī)院，在任何一家定點(diǎn)醫(yī)院報(bào)銷(xiāo)比例都是相同的；新農(nóng)合也有定點(diǎn)醫(yī)院，但是在鄉(xiāng)鎮(zhèn)級(jí)別醫(yī)院的住院報(bào)銷(xiāo)比例最高，縣級(jí)、市級(jí)、省級(jí)醫(yī)院的報(bào)銷(xiāo)比例依次降低。

兩者各有利弊。醫(yī)保報(bào)銷(xiāo)比率大些，但繳費(fèi)也多（按月繳納）。農(nóng)村合作醫(yī)療繳費(fèi)少（按年繳納），報(bào)銷(xiāo)相對(duì)少點(diǎn)，主要是在城市醫(yī)院報(bào)銷(xiāo)比率低。越高的醫(yī)院報(bào)銷(xiāo)越低。主要是針對(duì)農(nóng)村戶(hù)口。在縣級(jí)以下醫(yī)療單位比較劃算 對(duì)你的補(bǔ)充問(wèn)題進(jìn)行回答。報(bào)銷(xiāo)比率是按繳納金額計(jì)算的。